В 1924 году приказом начальника здравотдела Московско-Курской железной дороги, в селе Люблино были открыты Люблинская железнодорожная больница и родильный приют на тридцать пять коек. Больнице было присвоено имя наркома здравоохранения Н. Семашко. Сам Николай Александрович присутствовал на открытии больница и оставил теплую надпись в красной книге больницы с пожеланиями плодотворной работы на пользу железнодорожных рабочих и работниц.
По тем временам больница была прекрасно оснащена и оборудована. Но скоро одноэтажного первоначального здания больнице стало не хватать. Переезд в двухэтажное здание по улице Осоавиахима состоялось в 1941 году. В настоящее время это современная улица Судакова.
В годы Великой Отечественной войны сотрудники больницы принимали раненых фронтовиков. А их было множество. Койко-места мастерили из любого свободного места. Подлеченные бойцы отсюда снова стремились попасть на фронт.
Когда в 1947 году больница объединилась с Люблинской железнодорожной поликлиникой, то вновь образованное единое учреждение стало именоваться Люблинской объединенной больницей им. Семашко.
Территория и штат сотрудников больницы масштабировался ежегодно. Поэтому с 1952 года больницу перемещают на территорию нынешнего ее расположения. В 1959 году Больница им. Семашко получает название «Дорожная больница №1 им. Н.А. Семашко
Московской железной дороги». В 1960 году село Люблино стало частью города Москвы, а точнее одним из ее юго-восточных районов.
В 1973 году на территории больницы, при поддержке руководства Московской железной дороги был открыт семиэтажный терапевтический корпус на 710 коек. Заметно возрос уровень условий для страдающих пациентов.
В 1992 году больничный кластер обзавелся новый семиэтажным корпусом поликлиники на 750 посещений за смену. В 1994 году был возведен такой необходимый населению хирургический корпус. В том же году больницу переименуют в ГУЗ «Дорожная больница им. Н.А. Семашко на ст. Люблино Московской железной дороги».
В 2003 году городские поликлиники на станциях Перово, Куровская, Раменское и Савеловская присоединяются к больнице им. Семашко, и уже в следующем году в больнице разворачивается масштабный капитальный ремонт трехэтажного больничного корпуса, а название больницы также претерпевает изменения. Теперь больница является клинической базой ведущих медвузов Москвы.
С 2005 года больница им. Семашко становится негосударственным учреждением здравоохранения, а с 2012 года, когда в больнице произошли глобальные преобразования, обновленное медучреждение получила новые отделения скорой медицинской помощи, два аптечных пункта, женскую консультацию, подологический кабинет, ревматологический центр, нейрохирургическое и эндокринологическое отделение. Современный и качественный ремонт больничных корпусов был направлен, в первую очередь, на комфортное пребывание пациентов.
В 2014 году на территории больницы ввели в эксплуатацию новые помещения центра травматологии и ортопедии, установили новейшее диагностическое оборудование, отремонтировали приемное отделение больницы.
Никогда не прекращалась в больнице им. Семашко научная работа. В разные годы в больнице работали ведущие отечественные специалисты, такие имена как Апакидзе, Широкинский, Святухин, Кассирский и другие самые блистательные деятели медицинских наук.
За годы своей деятельности больница им. Семашко неоднократно была отмечена самыми высокими наградами, а сотрудники большого медицинского коллектива получали грамоты, медали и премии.